齐齐哈尔工程学院的前身，是成立于1958年的齐齐哈尔第一机床厂重型机床制造学院，其间易名为齐齐哈尔第一机床厂“七·二一”工人大学、齐齐哈尔第一机床厂职工机电学院。1993年，学校为支持国有企业公司化改造与企业签订经济分离合同，成为全国第一家国企学校与企业分离的典范，易名为黑龙江东亚大学。2001年，省政府批准在黑龙江东亚大学基础上成立齐齐哈尔职业学院，结束了齐齐哈尔市没有地方普通高校的历史。2010年4月，教育部批准齐齐哈尔职业学院升格更名为齐齐哈尔工程学院，学院属本科层次的普通高校。
学校设有机电工程系、交通工程系、建筑工程系、管理工程系、信息工程系、开设计算机科学技术、艺术设计、软件技术、动漫设计与制作，环境艺术设计，家具设计与制造、应用电子技术、电子商务、英语、财务管理、护理学、土木工程、工程管理、建筑工程技术、工程造价、道路桥梁工程技术、园林技术、工程测量技术、专业，会计电算化、市场营销、物流管理、食品营养与检测、汽车服务工程、交通运输、车辆工程、汽车检测与维修技术、汽车技术服务与营销、汽车电子技术、工程机械运用与维护、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、材料成型及控制工程等专业。
齐齐哈尔工程学院现任校长曹勇安。
