2012年黑龙江科技职业学院与黑龙江工商职业学院合并组建黑龙江职业学院，将原黑龙江科技职业学院校区调整为黑龙江职业学院第二校区。第二校区不断创新办学体制机制，推行职业教育进园区，探索集团化办学，牵头成立黑龙江省畜牧兽医职教集团，并成为理事长单位。与蒙牛集团、伊利集团、大北农集团、飞鹤乳业、辉山乳业等300余家知名企业建立深度融合校企合作。其中中国500强企业9家，上市公司40余家。毕业生的吃苦耐劳、诚信敬业、过硬本领赢得社会和企业的青睐。近年来，连续出现毕业生供不应求的局面，实习就业渠道畅通，毕业生平均就业率达98.95%。
学校设有动物科学系、动物医学系、生物工程系、制药工程系、食品工程系、经济贸易系、信息工程系、机电工程系、基础部9个系部，开设畜牧兽医、制药技术、食品、计算机、机械制造、经济贸易、农林类相关专业38个。
黑龙江畜牧兽医职业学院现任校长包艳明 。
