温州科技职业学院是以温州市农科院为基础筹建的。温州市农科院是2000年2月由原来的温州市农科所、温州市蔬菜科学研究所和温州农校合并组建而成，同时挂“浙江省温州农业学校”牌子，是一所集教学科研、示范推广为一体的机构，是全国唯一的农业科研教学合二为一的单位。
院（校）具有50多年的办学历史，温州农业学校的前身是1950年8月由省文教厅批准建立的“浙江省立温州农业技术学校”，于1983年恢复建设。办学以来共为社会输送了9000多名优秀毕业生，其中大部分已担任领导职务或成为业务骨干，在温州有较大的影响力。
院校的科研工作已有50多年的历史,历史上取得许多重大的科研成果，曾受到国务院嘉奖，获得国家科技进步奖3项，国家发明奖2项，省
部级科技进步奖50余项，市级科技成果奖项200余项。研究领域涉及农作物育种、栽培技术、植物保护、生态环境、农产品检测、畜牧兽医、食品加工、园林设计、科技信息等领域，温州白猪、水稻珍汕资源的育成以及细绿萍繁育技术的发明等享誉农业科技界，与俄罗斯、以色列、澳大利亚、新西兰等国家的研究机构、公司、企业以及国内浙江大学、浙江省农科院、福建省农科院等高校和科研机构均建立了比较紧密的科研合作关系。在“139富民攻坚战”、 “菜篮子工程”、“食无忧工程”、效益农业、现代农业发展、社会主义新农村建设等方面均发挥着非常重要的作用。[
