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学校自建校以来，已为国家培养输送毕业生6万多名，毕业生中87%在新疆就业、72%植根南疆，内地生源有60%以上留疆工作。毕业生遍布南疆各地州、县，兵团各师团党政机关、基层单位、山区牧区，具有政治可靠、实践能力强、吃苦耐劳的优良品质，用人单位普遍评价“下得去，留得住，用得上，干得好”，为自治区、兵团特别是南疆的经济发展、社会进步、政治稳定、民族团结和基层政权建设做出了突出贡献，确立了学校在“稳疆兴疆，富民固边”中不可替代的地位。学校已成为新疆高层次人才培养的重要基地、南疆干部的摇篮。据自治区人事厅、教育厅统计公布，我校毕业生就业率连续10年排在自治区高校的前列。2007年9月，学校在教育部本科教学工作水平评估取得优秀结果。

学校加强与国内外高校、科研院所在科学研究、人才培养等多方面的合作和学术交流，特别是中国农业大学、浙江大学、华中农业大学、北京化工大学、东华大学团队式对口支援取得实效，与西北农林科技大学、东北农业大学、兰州大学、武汉大学、南京农业大学等高校建立了紧密的合作关系，与中国农科院“十一所一院”建立了全方位实质性合作关系。国际交流合作方面，与西澳大学、伦敦大学、华盛顿州立大学、台湾静宜大学、哈萨克斯坦国立农业大学等20余所国（境）外高校建立了交流合作关系。同时与南疆各地州、县和兵团各师、农牧团场紧密联系，走产、学、研相结合的道路，积极开展科技服务扶贫，学校先后选派30多名科技副县（团）长到地方和团场挂职。教师和学生开展科技咨询、培训和技术推广工作，培训各类人员6万多人次。