新疆医科大学坐落于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市风景秀丽的鲤鱼山下，是一所具有光荣传统的高等医学院校，其前身新疆医学院始建于1954年，1956年建成招生。新疆医学院的兴建，受到了毛泽东、周恩来、朱德等中央领导人的亲切关怀和大力支持，毛泽东主席亲自决策将新疆医学院的建设纳入“一五计划”156个重点项目。1998年6月新疆医学院与新疆中医学院合并成立了新疆医科大学，江泽民同志题写了校名。2011年11月4日，国家卫生部与自治区签署了共建该校的协议，为学校各项事业的发展带来了新的动力和机遇。
学院有中维西医结合临床、中医骨伤科学、中医各家学说、中医皮肤病学、中医老年病学、临床中药学、中医络病学（培育）、中医文化学（培育）8个国家中医药管理局重点学科；有内科学、外科学、妇产科学、影像医学与核医学、麻醉学、病原生物学、中西医结合临床、生药学、药理学、肿瘤学、中医方剂学（培育）11个自治区级重点学科；有19个自治区级研究所（中心）。有1个博士后科研工作站（新疆维吾尔自治区中医院博士后科研工作站），有临床医学、公共卫生与预防医学、药学3个博士后科研流动站；有2个一级学科博士学位授权点，25个二级学科博士学位授权点，1个专业博士学位授权点；有10个一级学科硕士学位授权点。
新疆医科大学校长是 哈木拉提·吾甫尔 。
