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皖南医学院地处素有“长江巨埠、皖之中坚”之称的历史名城——芜湖市，濒临浩瀚长江，汇集江南神秀。学校建于1958年，时为芜湖医学专科学校；1971年并入安徽医学院，为安徽医学院皖南分院；1974年经国务院批准独立建校，命名为皖南医学院；1981年学校获得国务院学位委员会学士学位和硕士学位授予权；1998年一次性通过教育部本科教学工作合格评价；2008年顺利通过教育部本科教学工作水平评估并获优秀等级。
学校设有本科教育设有临床医学、法医学、口腔医学、麻醉学、影像医学、药学等21个专业，护理、药学等9个专科专业，涉及医、理、工、管、经、法6个学科门类；现有生物学、基础医学、临床医学等3个硕士一级学科授权点，包括生理学、神经生物学、病原生物学、病理学与病理生理学、法医学、内科学、神经病学、影像医学与核医学、外科学、妇产科学、肿瘤学、麻醉学、中西医结合基础、药理学及应用心理学等31个二级学科，基本涵盖了基础医学及临床医学各学科。
皖南医学院校长：章 尧 。