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学院设有水利工程学院、建筑工程学院、交通与测绘工程学院、经济与贸易学院、机电工程学院、信息工程学院、生物工程学院（现代农业学院）、生态环境工程学院、药物与化工学院、动物工程学院、旅游与管理学院、文理学院、继续教育与培训学院、国际学院等16个学院、教学部。开设有农、林、水、理、工、管、经济等大类73个高职专业，土木工程、园艺技术、会计等3个本科联办专业。其中水利水电建筑工程、生物技术及应用等4个专业为国家级教学改革试点专业，园林工程、畜牧兽医、经济管理、机电设备运行与维护、园艺技术、生物制药技术等11个专业为省级重点专业。设有人力资源与社会保障部、农业部等四部委的多项行业工种技能鉴定站和全国大学英语、计算机等级考点，可承担176个职业（工种）技能鉴定任务。设有陕西省中职校长培训基地、陕西省中职骨干教师培训基地、陕西省阳光工程培训基地等7个基地，建有华北水电学院等5所本科院校函授站，形成了融短期技能培训、中长期职业培训、成人本科学历教育、全日制高等职业教育和联办本科为一体的多形式、多层次办学格局。学院创办有《杨凌职业技术学院学报》、《高职教育研究》等刊物。

学院秉承“致用以学，行知并进”的校训、“照准目标，矢志不渝”的精神和“以人为本，质量立校，特色办学，创新发展”的办学理念，坚持“以立德树人为根本，以服务发展为宗旨，以促进就业为导向”的办学方针，实施质量立校、人才强校、改革兴校、特色名校四大战略和名牌专业工程、教学名师工程、实训基地工程、教学质量工程、产学研合作教育工程、素质教育工程、招生就业工程、管理创新工程、基础设施建设工程、文明校园工程等十大工程，办学事业取得了长足发展。

校企合作成效显著，职业教育特色鲜明。实施了百县千企联姻工程，按照优势互补，资源共享，合作创新，共赢共进的原则，与省内外142个县（区）政府、1332家企业建立了长期友好合作关系，建立了163个融学生实训、教师锻炼和科研试验、社会服务、毕业生就业为一体的综合基地，形成了“学校、企业、政府、学生四方受益”的互惠互利良性机制。牵头成立了杨凌现代农业职业教育集团，构架了中职和高职教育衔接、教学科研生产零距离对接、人才培养和职业要求、社会需求统一的职业教育体系。

教育教学创新，人才培养求精。学院依托国家示范性院校建设项目，不断深化以能力为本位，以专业建设为核心的教育教学改革，构建了以国家级重点专业为龙头，以省级重点专业、院级重点专业建设为支撑的三级专业建设体系。引进、吸收了德国、澳大利亚、香港等职业教育有益经验，按照“工作过程导向”和“学习预期成果”的课程建设思路，采取“解构、压缩、精简、整合、拓展”等方法，构建了以职业岗位（群）核心能力或典型工作任务为基础的课程体系和以动手能力培养为主的实践教学体系，形成了“季节分段、工学交替”、“情景化、模块式”、“合格+特长”等适合专业特点的10多种人才培养模式。建成国家级精品资源共享课3门，主持国家专业教学资源库课程7门，省级精品课程19门，国家林业局精品课程1门，教指委精品课程7门，院级精品资源课96门。近三年学生“双证书”获取率一直保持在98%以上，学生参加各类职业技能大赛获得全国高职院校农业职业技能大赛一等奖等奖项40多项次，增强了学生的可持续发展能力。