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学校的科学研究工作持续稳步扩大规模，重点推进“优化科技资源强能力、集中科技服务上水平”。围绕“提升内涵，强化特色”的总体目标，以制度创新为突破口，强化科研激励机制，持续推进原始创新，集中开展集成创新和引进消化吸收再创新。在科研项目承担方面，“十一五”以来，学校先后承担自治区级以上科技项目800余项，经费总量比“十五”期间增加了4.5倍。重点重大科技项目实现重要突破，先后承担和完成了“黄河河套地区盐碱地改良及脱硫废弃物资源化利用关键技术研究与示范”等国家科技支撑计划项目，“资源高效利用与生态环境安全重大问题研究”等国家重大基础研究前期研究专项项目和课题，以及国家科技攻关计划项目、国家农业成果资金转化项目、“863计划”引导项目、国家重点新产品计划、“948”项目等重大项目（计划）60余项。承担了国家自然科学基金和国家社科基金项目140余项，自治区级以上哲学社会科学项目168项，自治区科技攻关等自然科学类项目320余项。学校先后与自治区5个市、10余个龙头企业及区内100余家中小企业建立了全面合作关系，签订合作协议，开展实质性合作和广泛服务。科技成果方面，取得了一批标志性成果，并在国家科技进步二等奖、何梁何利基金科技创新奖、自治区科学技术杰出贡献奖等方面实现了突破。

学校坚持开放办学，把对外合作交流作为学校内涵建设的重要抓手，形成了“一体两翼一个平台”（服务学校整体对外开放战略；国际合作，国内合作；校友工作网络）的对外合作交流工作格局。国内合作在深化、创新与上海交大对口支援工作模式的基础上，先后与山东大学、华中科技大学、西北农林科技大学、吉林大学、南京师范大学、南昌大学、福州大学、上海师范大学等9所高校开展了实质性的交流合作，形成“一对九”的合作格局。国际合作立足于民族区域特色和特色优势学科，以中日国际联合研究所、西夏学研究院、回族研究院以及阿拉伯语人才培养，阿拉伯文化研究和生物技术、生态学研究为平台，先后与日本岛根大学、创价学会（大学），阿联酋迪拜大学，美国密苏里州立大学，挪威红十字会北欧世界联合学院等十几个国家的十多所高校结为重点合作伙伴。宁夏大学是教育部批准的招收留学生和中国政府奖学金来华留学生培养高校，自1992年以来，先后有20多个国家的近千名留学生来校学习。与阿联酋迪拜大学联合建立了海湾地区第一所孔子学院。学校的校友工作有了长足的发展和进步，先后成立宁夏五市校友会、银川工商企业界校友会及北京校友会。