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上海海关学院是经教育部批准设立的具有高等学历教育招生资格的全日制普通高等学校，直属于中华人民共和国海关总署。中国海关高等教育已有百余年历史，1908 年清政府在北京建立税务学堂（后更名为税务专门学校，并迁址上海），该学堂是世界上最早从事海关高等专业教育的学校之一。新中国成立后，1953 年上海海关学校设立；1980 年经国务院批准，升格为上海海关专科学校；1996 年更名为上海海关高等专科学校。 2007 年3 月，教育部批准在上海海关高等专科学校的基础上设立上海海关学院。
学院现设有海关管理系、经济与工商管理系、法律系、外语系、基础部等五个教学系（部）；设置了海关管理、物流管理、审计学、国际商务、税收学、法学、英语等7 个本科专业和税务硕士专业学位，涵盖管理学、经济学、法学、文学等4 个学科门类。其中，海关管理专业为国家控制布点特设专业，法学、税务专业分别是教育部第二、三批高等学校特色专业建设点。目前全日制在校生1833 人，其中本科生1803 人、研究生30 人。
上海海关学院校长： 肖建国。