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工商管理专业作为南开大学建校初期创立的商科的主要继承者之一，实力很强，2009年教育部学科评估，南开大学的工商管理学科排在第三位。工商管理的录取分数在南开算是顶尖的。入学后的课程也比较难，对数学要求高。

南开大学化学系创建于1921年，是国内最老、最大和最具实力的化学系之一。化学学科在06年教育部一级学科评比中，与北大并列第一；南开化学是南开几个支柱型专业之一了，南开的院士，化学占了一半。

南开政治学与行政学排名全国前五，属于政治学一级学科，法学大类，毕业一般授予法学学士学位，主要侧重于理论的学习，大致可分为政治哲学和政治科学。

物理系是南开大学理科建立最早的系之一，目前全国排名13，设有物理学和材料物理两个本科专业。物理学专业设有凝聚态物理、理论物理、光学、信息物理与计算机应用等四个专业方向，光学和凝聚态非常强，差不多一半的教授都在做相关内容，其次是理论方面，能在全国排上前十。

南开大学数学系由姜立夫先生创建于1920年，当代著名数学家陈省身先生等早年就毕业于南开数学系。数学与应用数学是数学系三个本科专业之一。数学系的竞争是整个南开中可以说是最激烈的，保研、出国率都很高。

南开大学英语专业全国排名前十，是教育部“英语特色专业建设点”、天津市重点学科，是首批获得硕士学位授予权的高校，同时也有博士学位授予权。南开英语专业的整体实力挺强的，最好的是英美文学

哲学系最早成立于1919年，是一个历史悠久、基础雄厚的专业。目前，南开哲学专业是国内哲学学科仅有的7个“国家文科基础学科人才培养与科学研究基地”之一，是一级学科博士学位授予权单位。该系基地本科生入学后享受新生奖学金比例达60％，毕业生免试推荐为硕士研究生的比例为25％、其中一部分学生可直接推荐为硕博连读生。

南开大学历史学全国前三。1919年南开大学创建伊始，即设置有历史学门。1996年，历史学科更被国家教委确定为“211”工程首批立项建设的单位。南开历史学科为国家级一级重点学科，师资雄厚。在南开，“历史学”和“世界历史”是分开的两个专业，但两者很多课是一起上的，大二以后才分别上自己的部分。

南开大学电子信息与光学工程学院有5个本科专业，分别为：电子信息科学与技术、通信工程、电子科学与技术、微电子科学与工程、光电信息科学与工程专业。其中光电子专业排名全国第一，学院的光电方面很强，相比之下微电子专业实力还是有差距的。