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学校以社会服务为载体，努力走出一条具有特色的地方高校服务区域经济社会发展的创新道路，不断提升社会服务整体水平。现建有中国海洋科技创新引智园区，正在筹建国家级大学科技园，与浙江沿海政府部门、企事业单位以及国内大院名校组建了一批科技创新服务平台。建有海洋勘测规划设计研究院，拥有国家级计量认证、海域使用论证（乙级）、渔业船舶设计（乙级）、农产品质量安全检测、渔业污染事故调查鉴定（乙级）、测绘（丁级）和浙江省海域评估、浙江省海域基准价核定等资质。开展专业技术人员继续教育及渔业、石油化工、船员、国际商务英语、教师教育等专业技能培训，拥有船员质量体系、27个船员培训项目（含无限航区一等船长和轮机长）、远洋渔业船员一级培训、石油化工职业技能鉴定、国际商务英语考试二级培训等资质，设有全国渔业验船师培训基地、浙江省远洋渔业培训中心、中国石化销售公司舟山培训中心等培训组织，是全国海洋意识教育基地和全国科普教育基地。

学校积极推进教育国际化，深化与国（境）外高等院校、研究机构合作与交流，开展多种形式的教育与科研合作。多年来，定期举办“中国浙江国际海洋科技论坛”系列会议，倡议建立了环东海（中日韩）海洋科教合作机制。拥有国家科技部国际科技合作基地，与国（境）外50多所高校和科研院所建立了教学科研合作关系，建立了8个中外（境外）合作实验室、研究中心，与意大利比萨大学、挪威生命科学大学、日本东京海洋大学、俄罗斯南乌拉尔国立大学等高校开展联合培养博士究生项目。与俄罗斯圣彼得堡国立海洋技术大学合作举办船舶与海洋工程专业本科教育双学士项目，与意大利比萨大学等高校合作举办3个双硕士项目。海洋科学本科专业为浙江省首批国际化专业，设有俄罗斯对外俄语考试系统浙江考试点。建有国际海洋教育学院，具有“中国政府奖学金”留学生培养单位资格和面向港澳台地区招收本科生资格，是浙江省国际化特色高校。

21世纪是海洋世纪，学校正围绕建设“海洋强国”和“21世纪海上丝绸之路”战略部署，紧密结合浙江海洋经济发展示范区、浙江舟山群岛新区、舟山自由贸易港区和舟山江海联运服务中心建设发展需要，坚持立足东海、面向全国、走向世界，以建成特色鲜明并在国内外具有重要影响的综合性海洋大学为战略任务；坚持特色发展，加强协同创新，推进国际合作，深化综合改革，不断完善大学治理体系，大力实施创新创业教育，加快提升学生竞争力和教师影响力，努力成为我国重要的海洋人才培养基地、海洋科技研发平台、海洋高新技术孵化园区、海洋科技引智载体和海洋人文社科研究中心。