十二中建校以来，学校管理架构完善，一直坚持“以人为本，全面育人”的管理理念， 学校“ 依据党的教育方针和国家的教育法律法规，依靠上级政府和教育主管部门的支持，依托社会各方力量的协助，依赖全校师生的全力拼搏，依照现代教育发展的规律，顺应其趋势，努力把十二中办成具有良好社会声誉、教育教学成绩良好、全面实施素质教育、深受家长及学生喜爱的一流的面上普通完全中学”的总体目标，还提出了以科学发展观为指导，积极构建和谐校园，努力打造精品教育；强调以科学精神、人文气息和人格魅力支撑学校的发展，努力把学校打造成为肇庆城区西部一颗璀璨的教育明珠；在坚持“ 依法治校、科研兴校、改革活校、特色立校”的办学思路基础上，又提出了“质量强校、人才旺校、文化铸校、和谐荣校”的办学理念，学校管理严格依法办事，坚持公开、公平、公正、公道的管理原则。
为了加强学校管理效益， 2002 年 9 月开始，学校推行“分部管理”，建立了初中综合管理小组和高中综合管理小组，分别行使初中、高中的教师队伍建设、 ` 教学质量的提高和学生管理等职责，为学校的可持续发展奠定了坚实的管理基础。
该校是粤西地区（含肇庆、云浮、阳江、茂名、湛江）唯一的一所 成为 全国绿色学校 的中学 、肇庆市第一所广东省心理健康教育示范学校、广东省贯彻《学校体育工作条例》和《学校卫生工作条例》先进单位以及肇庆市文明单位、花园式单位、卫生先进单位、环保教育先进集体、普法宣传教育先进单位、职业道德建设“十佳单位”，被肇庆市教育局评为市一级学校。
校徽释义三个相连的圆圈既代表以培养德、智、体全面发展的学生为目的，又代表着学校、社会、家庭“三位一体”共同致力于培养一代新人；圈中的三颗星寓意着坚持“三个面向”的办学方向；两个弯曲的弧形为“十二中”第一个汉语拼音“Ｓ”的变形体，并构成一团火焰，象征着学校和全体师生奋发向上、进取不息、追求不止；火焰下的书本为“十二”的“二”字形，比喻学校以教书育人为天职。
校训和谐 笃学 求实 奋进
校风明德 乐智 尚体 育美
教风敬业 爱生 团结 创新
学风勤学 守纪 爱校 自强
办学原则以科学精神、人文气息和人格魅力支撑学校持续发展!
办学思路依法治校 科研兴校 改革活校 特色立校
办学理念质量强校 人才旺校 文化铸校 和谐荣校
